Полиморфизм микросателлитов и воспроизводительные способности полутонкорунных овец в Приполярье

Изучены микросателлитные профили и воспроизводительные признаки полутонкорунных овец печорской популяции. Цель исследования – выявление возможных взаимосвязей STR-маркеров с генами или их комплексами, контролирующими генетическую изменчивость признаков приспособленности полутонкорунных овец в условиях Приполярья. Генетические анализы выполнены с использованием набора реагентов COrDIS Sheep по 12 локусам и маркеру пола AMEL. Результаты генотипирования обработаны в программах Structure Version 2.3.4 и GenAlEx 6.5. Весь массив генотипированных овец c учетом породности разделен на две группы. К первой отнесены помеси ‘печорская породная группа × ромни-марш’, ко второй – помеси ‘печорская породная группа × ромни-марш × куйбышевская порода’. Массив данных в программе Structure Version 2.3.4 подразделили на четыре кластера при пороге вероятности ≥ 0,75. Животных, вероятность членства которых в одном кластере не достигла порогового уровня, объединили в нулевой (сборный) кластер. Генетическая дистанция между первой и второй группами составила 0,015. Первая группа представлена полилокусными генотипами, отнесенными к трем кластерам, вторая группа – полилокусными генотипами, разделенными на пять кластеров. Минимальные генетические дистанции по Райту и Нею (несмещенная оценка) установили между нулевым и первым кластерами. Величина данных показателей для первого и второго кластеров составила: FST = 0,047, uDN = 0,354. Между первым и третьим, третьим и четвертым кластерами генетические дистанции были максимальными. Внутри первой и второй групп достоверных различий по показателям фертильности между особями разных кластеров не установлено. Различия особей второй группы четвертого кластера с особями первой группы первого кластера по возрасту первого окота, молочности, темпу размножения и интенсивности роста ягнят до отъема были достоверными соответственно при р ≤ 0,001, р ≤ 0,01, р ≤ 0,01, р ≤ 0,05. Несмотря на невысокую генетическую дистанцию между первой и второй группами по микросателлитам, разница между ними по среднему возрасту первого ягнения, темпу размножения и интенсивности роста приплода до отбивки была достоверной при р ≤ 0,05, р ≤ 0,01 и р ≤ 0,05. Выявлено, что скрещивание овец печорской популяции с куйбышевской породой оказало отрицательный эффект на некоторые показатели фертильности овец и интенсивность роста приплода в подсосный период. Для получения более определенных выводов о взаимосвязи полиморфизма микросателлитов с селективными признаками необходимо увеличение численности выборок.

1. Zlobin A.S., Nikulin P.S., Volkova N.A., Zinovieva N.A., Iolchiev B.S., Bagirov V.A., Borodin P.V., Aksenovich T.I., Tsepilov Ya.A. Multivariate Analysis Identifies Eight Novel Loci Associated with Meat Productivity Traits in Sheep // Genes (Basel). 2021. Vol. 12. N 3. P. 367. DOI: 10.3390/genes12030367.

2. Zamani W., Ghasempouri S.M., Rezaei H.R., Hesari A.R.E., Ouhrouch A. Comparing polymorphism of 86 candidate genes putatively involved in domestication of sheep, between wild and domestic Iranian sheep // Meta Gene. 2018. Vol. 17. N 2. P. 223–231. DOI: 10.1016/j.mgene.2018.06.0154.

3. Zhi-Liang H., Park C.A., Reecy J.M. Bringing the Animal QTLdb and CorrDB into the future: meeting new challenges and providing updated services // Nucleic Acids Research. 2022. Vol. 50. P. 956–961. DOI: 10.1093/nar/gkab1116.

4. Zhi-Liang H., Park C.A., Reecy J.M. Building a livestock genetic and genomic information knowledgebase through integrative development of Animal QTLdb and CorrDB // Nucleic Acids Research. 2019. Vol. 47. P. 701–710. DOI: 10.1093/nar/gky1084.

5. Галинская Т.В., Щепетов Д.М., Лысенков С.Н. Предубеждение о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. 2019. T. 55. № 6. С. 617–632. DOI: 10.1134/S0016675819060043.

6. Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А. Анализ аллелофонда полутонкорунных овец печорской популяции с помощью STR-маркеров // Генетика. 2023. Т. 59. № 6. С. 1–7. DOI: 10.31857/S0016675823060103.

7. Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А. Микросателлитный профиль, гетерозиготность и фертильность овец // Аграрный вестник Урала. 2024. Т. 24. № 4. С. 510‒521. DOI: 10.32417/1997-4868-2024-24-04-510-521.

8. Falush D., Stephens M., Pritchard J.K. Inference of population structure: Extensions to linked loci and correlated allele frequencies // Genetics. 2003. Vol. 164. N 4. P. 1567–1587. DOI: 10.1093/genetics/164.4.1567.

9. Falush D., Stephens M., Pritchard J.K. Inference of population structure using multilocus genotype data: dominant markers and null alleles // Molecular Ecology Notes. 2007. Vol. 7. N 4. P. 574–578. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2007.01758.x.

10. Hall S.J.G. Genetic Differentiation among Livestock Breeds-Values for FST // Animals. 2022. Vol. 12. N 9. Р. 1115. DOI: 10.3390/ani12091115.