Показатели оценки племенной ценности крупного рогатого скота по недостаткам экстерьера в зависимости от уровня гомозиготности и геномного инбридинга

Проведено исследование, направленное на определение влияния уровня гомозиготности (Са) и геномного инбридинга (F_ROH) на оценку племенной ценности (EBV) по недостаткам экстерьера. Для расчета коэффициента инбридинга (F_х) использовали 355 быков и 42 246 дочерей, для расчета уровня гомозиготности по STR-маркерам – 341 быка и 39 749 дочерей. Коэффициент инбридинга вычисляли по формуле Райта – Кисловского, уровень гомозиготности – как отношение количества гомозиготных локусов к общему числу анализируемых локусов. Для оценки влияния геномного инбридинга использовали данные по SNP-маркерам 356 быков-производителей, далее F_ROH присваивали их дочерям (n = 42 248). Уровень геномного инбридинга рассчитывали как отношение суммы длин всех паттернов гомозиготности (в миллионах пар нуклеотидов) в геноме быка-производителя к общему размеру генома (в миллионах пар нуклеотидов) для 29 аутосом крупного рогатого скота, перекрываемых SNPs (в процентах). Для экстерьерного профиля применяли методику Союза «Мосплем». Такие недостатки, как «крыловидные лопатки» и «перехват за лопатками», имели тенденцию к увеличению с повышением коэффициента инбридинга соответственно от –0,000213 и –0,000022 при F_x = 0,00% до 0,00048 и 0,000511 при F_x ≥ 6,69%. Недостаток «крышевидный зад», наоборот, имел тенденцию к снижению EBV от 0,001083 в первой группе до –0,001688 в четвертой. При рассмотрении влияния уровня гомозиготности, рассчитанного по STR-маркерам, на оценку племенной ценности можно отметить группу недостатков, которые имели тренд на увеличение от первой (Са = 0%) до второй (Са = 8–50%) и третьей групп (Са = 55–77%): –0,000023/0,000031/0,001002 – мягкая спина; –0,001562/0,00017/0,000563 – слабая поясница; 0,000026/0,000048/0,000714 – крыловидные лопатки; –0,000349/0,000024/0,000637 – перехват за лопатками; –0,009635/0,002585/0,10081 – высокий хвост; –0,002816/–0,000761/0,012315 – размет передних ног; 0,000009/0,000031/0,000051 – бочковидная постановка задних ног; –0,001549/0,001260/0,009468 – косое дно вымени. Выявлено снижение EBV по недостаткам «высокий хвост» и «мягкие бабки» соответственно от 0,008866 и 0,006780 в первой группе при F_ROH = 0,05–4,19% до –0,003860 и –0,002448 в четвертой при F_ROH = 10,97–17,71%. Контроль уровня гомозиготности посредством современных методов геномной селекции наряду с оценкой племенной ценности по признакам и недостаткам экстерьера послужит связующим звеном в селекционных мероприятиях сегодняшнего дня как на индивидуальном, так и на популяционном уровнях ведения животноводства.

1. Богатова П.С., Лиходеевский Г.А., Лиходеевская О.Е. Взаимосвязь геномного и расчетного инбридинга в популяции крупного рогатого скота голштинской породы Свердловской области // Аграрный вестник Урала. 2024. № 9. С. 1158–1171. DOI: 10.32417/1997-4868-2024-24-09-1158-1171.

2. Lakhdar H., Koca K., Özkan E. et al. Genomic evaluation of milk production traits in Turkish Holstein cattle using single-step GBLUP method // Livestock Studies. 2023. Vol. 7 (2). P. 127–136. DOI: 10.5281/zenodo.8067225.

3. Cortes-Hernández J.G., Ruiz-López F.J., Vásquez-Peláez C.G., García-Ruiz A. Runs of homozygosity and its association with productive traits in Mexican Holstein cattle // PLoS ONE. 2022. Vol. 17 (9). P. e0274743. DOI: 10.1371/journal.pone.0274743.

4. Dadousis C., Ablondi M., Cipolat-Gotet C. et al. Genomic inbreeding coefficients using imputed genotypes: assessing differences among SNP panels in Holstein-Friesian dairy cows // Frontiers in Veterinary Science. 2023. Vol. 10. P. 1142476. DOI: 10.3389/fvets.2023.1142476.

5. Makanjuola В.О., Маltесса С., Miglior Е., Schenkel F.S., Baes C.F. Effect of recent and ancient inbreeding on production and fertility traits in Canadian Holsteins // BMC Genomics. 2020. Vol. 21 (1). P. 605. DOI: 10.1186'si2864-020-07031-w.

6. Zixia Hou, Qi Zhang, Bin Zhang, Hongming Zhang, Lyuwen Huang, Meili Wang. Cattle Part Net: an identification approach for key region of body size and its application on body measurement of beef cattle // Computers and Electronics in Agriculture. 2025. N 232. P. 110013. DOI: 10.1016/j.compag.2025.110013.

7. Zhiyong Yin, Tao Wu, Lu Liu, Xianrui Zheng, Zongjun Yin, Yuwei Wang. Computer vision-based body measurement of cattle and pigs: a systematic review // Computers and electronics in agriculture. 2026. N 247. P. 111688. DOI: 10.1016/j.compag.2026.111688.

8. Xu X., Xiong B., Deng H., Liu D., Jiang B., Norton T., Song H. Fusion of keypoint detection and posture-aware correction for body measurement of dairy cattle // Computers and Electronics in Agriculture. 2026. N 251. P. 112047. DOI: 10.1016/j.compag.2026.112047.

9. Weng Z., Zhao B., Zheng Z. et al. Point-Hyena: a lightweight edge-deployable model for cattle body size measurement // Measurement. 2026. N 285. P. 122279. DOI: 10.1016/j.measurement.2026.122279.

10. Rodríguez-´Alvarez J.L., García-Alcaraz J.L., Díaz-Reza J.R., Navarrete-Molina C., Gonz´alez-Lazalde I., Amaro-Rodríguez I. Automated system for cattle classification using key point detection and coupled applications of neural networks and type-3 fuzzy sets // Engineering Applications of Artificial Intelligence. 2026. N 164. P. 113160. DOI: 10.1016/j.engappai.2025.113160.

11. Тулинова О.В., Романова Е.А., Березина В.В., Токарев А.И., Сермягин А.А. Оценка рисков проявления недостатков экстерьера вымени у коров айрширской породы с применением метода BLUP AM // Аграрная наука ЕвроСеверо-Востока. 2026. Т. 27. № 1. С. 178–189. DOI: 10.30766/2072-9081.2026.27.1.178-189.

12. Недашковский И.С., Контэ А.Ф., Сермягин А.А. Параметры генетической взаимосвязи по STR- и SNP-маркерам недостатков экстерьера дочерей голштинских быков-производителей с уровнем гомозиготности и геномного инбридинга отцов // Достижениянауки и техники АПК. 2024. Т. 38. № 2. С. 46– 52. DOI: 10.53859/02352451_2024_38_2_46.

13. Недашковский И.С., Контэ А.Ф., Сермягин А.А. Влияние уровня инбридинга у коров голштинской и черно-пестрой пород на частоту встречаемости недостатков экстерьера // Молочное и мясное скотоводство. 2024. № 3. С. 11–15. DOI: 10.33943/MMS.2024.88.77.003.

14. Недашковский И.С., Контэ А.Ф., Сермягин А.А. Показатели оценки племенной ценности по линейной оценке экстерьера в зависимости от коэффициента инбридинга и уровня гомозиготности // Аграрный вестник Урала. 2023. Т. 23. № 1. С. 55‒65. DOI: 10.32417/1997-4868-2023-230-01-55-65.

15. Недашковский И.С., Контэ А.Ф., Сермягин А.А. Влияние уровня геномного инбридинга голштинских быков-производителей на изменчивость показателей экстерьера и тип телосложения их дочерей // Достижения науки и техники АПК. 2023. Т. 37. № 6. С. 66–74. DOI: 10.53859/02352451_2023_37_6_66.

16. Смарагдов М.Г., Кудинов А.А. Полногеномная оценка инбридинга у молочного скота // Достижения науки и техники АПК. 2019. Т. 33. № 6. С. 51–53. DOI: 10.24411/0235-2451-2019-10612.