ПРИМЕНЕНИЕ ПРОГРАММНОЙ СРЕДЫ R ДЛЯ ДИСПЕРСИОННОГО АНАЛИЗА ДАННЫХ В СЕЛЕКЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЯХ
https://doi.org/10.26898/0370-8799-2017-5-11
Аннотация
Описан опыт применения программной среды R для дисперсионного анализа данных полевых опытов по изучению мутантных и гибридных форм ярового тритикале. Эксперимент проведен в 2014 г. в Новосибирской области. Изучено семь форм ярового тритикале. Опыт проводили при двух нормах высева (400 и 800 зерен/м2) и двух сроках посева (15 и 27 мая) в четырех повторностях методом рандомизированных повторений. Образцы оценивали по 9 признакам, связанным с урожайностью и качеством зерна. На примере данного полевого опыта рассмотрены графические способы анализа структуры данных в программной среде R. Для дисперсионного анализа результатов эксперимента использована трехфакторная линейная модель. Проведена проверка необходимых условий применимости модели с помощью критерия Шапиро – Уилка и теста Левене. Определена достоверность влияния факторов на результирующие признаки. Для выяснения существенности разностей средних значений использовал критерий Тьюки. На основе выбранной модели выполнен сравнительный анализ зерновой продуктивности изучаемых форм ярового тритикале. Мутантные и гибридные формы ярового тритикале в проведенном опыте показали более низкий уровень адаптивности к различным условиям произрастания по сравнению с сортом Укро.
Ключевые слова
Об авторах
А. Ф. ЧЕШКОВАРоссия
кандидат физико-математических наук, ведущий научный сотрудник
630501, Россия, Новосибирская область, пос. Краснообск
А. Ф. АЛЕЙНИКОВ
Россия
доктор технических наук, главный научный сотрудник, профессор
630501, Россия, Новосибирская область, пос. Краснообск
630092, Россия, Новосибирск, пр. Карла Маркса, 20
И. Г. ГРЕБЕННИКОВА
Россия
кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник
630501, Россия, Новосибирская область, пос. Краснообск
П. И. СТЁПОЧКИН
Россия
доктор сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник
630501, Россия, Новосибирская область, пос. Краснообск
Список литературы
1. Мастицкий С.Э., Шитиков В.К. Статистический анализ и визуализация данных с помощью R. – [Электронный ресурс]: URL: http://r-analytics.blogspot.com
2. R Development Core Team. R: A language and environment for statistical computing. – Vienna, Austria: R Foundation for Statistical Computing. – [Электронный ресурс]: URL: http://www.R-project.org/
3. Losert D., Maurer H.P., Marulanda J.J., Wьrschum T., Friedt W. Phenotypic and genotypic analyses of diversity and breeding progress in European triticale (Ч Triticosecale Wittmack) // Plant Breeding. – 2017. – Vol. 136. – P. 18–27.
4. Kuhling I., Redozubov D., Broll G., Trautz D. Impact of tillage, seeding rate and seeding depth on soil moisture and dryland spring wheat yield in Western Siberia // Soil & Tillage Research. – 2017. – Vol. 170. – P. 43–52.
5. Tams S.H., Bauer E., Oettler G., Melchinger A.E. Genetic diversity in European winter triticale determined with SSR markers and coancestry coefficient. // Theor. Appl. Genet. – 2004. – Vol. 108. – P. 1385–1391.
6. Алейников А.Ф., Чешкова А.Ф., Гребенникова И.Г., Стёпочкин П.И. Программные продукты для селекционной оценки сельскохозяйственных культур // Сиб. науч. вестн. – 2013. – № 17. – С. 164–171.
7. Чешкова А.Ф., Алейников А.Ф., Стёпочкин П.И. Анализ сопряженной изменчивости количественных признаков тритикале // Достижения науки и техники АПК. – 2016. – Т. 30, № 5. – С. 50–52.
8. Чешкова А.Ф., Алейников А.Ф., Стёпочкин П.И. Использование программной среды R для разведочного анализа данных в селекционных исследованиях // Информационные технологии, системы и приборы в АПК. «АГРОИНФО-2015»: материалы 6-й Междунар. науч.-практ. конф. – Новосибирск, 2015. – С. 182–187.
9. Чешкова А.Ф., Алейников А.Ф., Стёпочкин П.И. Использование программной среды R для кластерного анализа данных в селекционных исследованиях // Научно-информационное обеспечение инновационного развития АПК: материалы 8-й Междунар. науч.-практ. конф. – М.: Росинформагротех, 2016. – С. 468–472.
10. Чешкова А.Ф., Алейников А.Ф., Стёпочкин П.И. Применение графических возможностей программной среды R для анализа экспериментальных данных по селекции тритикале // Вычисл. технологии. – 2016. –Т. 21, спецвып. 1. – С. 104–115.
11. Айвазян С.А., Енюков И.С., Мешалкин Л.Д. Прикладная статистика: Исследование зависимостей: справ. изд. / под ред. С.А. Айвазяна. – М.: Финансы и статистика, 1985. – 487 с.
12. Доспехов Б.А. Методика полевого опыта. – М.: Колос, 1979. – 416 с.
13. Zuur A.F., Ieno E.N., Elphick C.S. A protocol for data exploration to avoid common statistical problems // Methods in Ecology and Evolution. – 2010. – Vol. 1. – Iss. 1. – P. 3–14.
14. Teetor P. R Cookbook. – Sebastopol: O’Reilly Media, 2011. – 413 p.
15. Chang W. R Graphics Cookbook. – Sebastopol: O’Reilly Media, 2012. – 396 p.
Рецензия
Для цитирования:
ЧЕШКОВА А.Ф., АЛЕЙНИКОВ А.Ф., ГРЕБЕННИКОВА И.Г., СТЁПОЧКИН П.И. ПРИМЕНЕНИЕ ПРОГРАММНОЙ СРЕДЫ R ДЛЯ ДИСПЕРСИОННОГО АНАЛИЗА ДАННЫХ В СЕЛЕКЦИОННЫХ ИССЛЕДОВАНИЯХ. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. 2017;47(5):88-96. https://doi.org/10.26898/0370-8799-2017-5-11
For citation:
CHESHKOVA A.F., ALEYNIKOV A.F., GREBENNIKOVA I.G., STEPOCHKIN P.I. APPLICATION OF THE R SOFTWARE ENVIRONMENT FOR ANALYSIS OF VARIANCE IN BREEDING RESEARCH. Siberian Herald of Agricultural Science. 2017;47(5):88-96. (In Russ.) https://doi.org/10.26898/0370-8799-2017-5-11